Искусственная летальность: как находят уязвимости раковых клеток

Цифры пугают: ежегодно в мире диагностируют более 12 миллионов новых случаев рака. И эта тенденция, увы, растёт. Химиотерапия и облучение — наш грубый, но проверенный арсенал, но он не всесилен. Учёные всё чаще задумываются о более изящном оружии — персонализированном и точечном, которое бьёт точно в цель, минуя здоровые ткани. Но как найти такую «ахиллесову пяту» у раковой клетки?

Один из самых многообещающих подходов — таргетная терапия, использующая феномен «искусственной летальности». Звучит грозно, но суть проста. Представьте два белка в клетке. Если «ломается» один — клетка ещё может выжить. Но если отказывают оба сразу — это её гарантированная гибель. Вот это взаимоусиление и есть искусственная летальность. Проблема в том, что таких пар-убийц известно катастрофически мало, пишет Phys.org. Найти их вручную в геномном хаосе — почти нереально.

И здесь на помощь приходит... нет, не магия, а большие данные и хитрые алгоритмы. Специалисты из Университета Суссекса создали инструмент под названием Slant, который умеет предсказывать, где могут скрываться такие смертельные для рака взаимодействия.

Как он работает? Алгоритм анализирует горы существующей информации, выискивая паттерны и закономерности, характерные для известных пар искусственной летальности. Потом он отправляется в «путешествие» по сложнейшей сети белковых взаимодействий, чтобы найти участки с похожей архитектурой. По сути, он ищет скрытые уязвимости, которые не видны человеческому глазу.

И что самое важное — его предсказания уже подтвердились в лабораторных экспериментах! Теперь все результаты выложены в открытую базу данных. Это как карта сокровищ для онкологов и исследователей: зашёл, нашёл потенциальную мишень для конкретного типа рака и понял, в каком направлении копать для создания терапии. Ощутимое ускорение, согласитесь?

Кстати, поиск уязвимостей идёт полным ходом и на других фронтах. Британские учёные с помощью технологии CRISPR выявили около 600 генов, критически важных для выживания 30 различных видов рака. Имея на руках такую точную генетическую карту мишеней, разработка новых, более эффективных лекарств становится уже не фантастикой, а вопросом времени. Будущее онкологии, похоже, становится всё более прицельным.