IMG-LOGO
image

13 июн. 2024

Просмотров: 79

Когда появится вакцина от рака: как искусственный интеллект создает лекарства

Цифровой мозг против рака: умные алгоритмы уже проектируют лекарства, о которых мы раньше и мечтать не могли. Это не фантастика, а сегодняшний день науки. Способность быстро просеивать горы данных — вот что делает этот инструмент бесценным в гонке за спасение жизней.
Но какие барьеры ещё нужно преодолеть? И когда же мы, наконец, получим лекарство? Об этом рассказывает Наталья Транкова, эксперт в области машинного обучения. Поехали разбираться.

Как применяются передовые технологии в разработке вакцин

Нейросети и машинное обучение стали для онкологов тем же, чем микроскоп для биолога. С их помощью учёные расшифровывают генетический код опухолей, читая последовательности ДНК и РНК как открытую книгу.

Чтобы понять, как мутация превращает здоровую клетку в убийцу, нужно заглянуть в трёхмерный мир белков. Именно здесь на помощь приходят инструменты вроде AlphaFold. Они предсказывают, как будет выглядеть и вести себя белок, рождённый из повреждённого гена. Это позволяет смоделировать взаимодействия на молекулярном уровне и, в итоге, выделить тех пациентов, для которых конкретное лечение станет спасением.

Когда появится вакцина от рака: как искусственный интеллект создает лекарства

Эффективность уже доказана в ключевых моментах. Умные алгоритмы анализируют геном и транскриптом опухоли, выискивая неоантигены — уникальные белки-маркеры, которые есть только на раковых клетках. Они как красные флажки для иммунитета.

ИИ не просто находит эти маркеры. Он отбирает самые «кричащие» из них, те, что вызовут максимальную иммунную атаку, и предлагает включить их в состав вакцины. Он же подбирает адъюванты — вещества-усилители, которые сделают вакцину ещё мощнее. Красиво, правда?

Когда появится вакцина от рака: как искусственный интеллект создает лекарства

Всё это основано на данных клинических испытаний. Анализируя биомаркеры — индикаторы состояния пациента после вакцинации, — можно оценить безопасность терапии, её эффективность и даже найти новые цели для атаки. Получается замкнутый, но очень продуктивный цикл.

Результаты разработки вакцин от рака

Немецкая BioNTech (да-да, та самая) использует умные системы для создания персонализированных противораковых вакцин. Их алгоритмы изучают геном опухоли, находят мутации и на их основе проектируют индивидуальное лечение.

Датская Evaxion Biotech пошла дальше. Её платформа PIONEER моделирует иммуногенность неоантигенов, чтобы создать вакцину от меланомы. Соединив биоинформатику, фармакологию и машинное обучение, они учатся точнее предсказывать, когда иммунитет пациента сможет победить болезнь.

Когда появится вакцина от рака: как искусственный интеллект создает лекарства

Duo Moderna и Merck применяют алгоритмы для анализа клинических данных, прогнозируя эффективность комбинаций вакцин и иммунотерапии. А в случае с вакциной NeoVax те же инструменты помогли оптимизировать её состав для пациентов с тяжёлой меланомой.

Исследователи из Калифорнийского университета в Сан-Диего создали алгоритм, который за короткое время моделирует тысячи сложных химических экспериментов. С помощью таких генеративных моделей они уже синтезировали 32 потенциальных лекарственных кандидата. Представляете этот масштаб?

Почему еще нет эффективной вакцины от рака

С момента первого секвенирования ДНК в 1977 году мы прошли гигантский путь. Но теперь столкнулись с новой задачей — масштабированием. Главная проблема в уникальности.

Когда появится вакцина от рака: как искусственный интеллект создает лекарства

Опухоли различаются не только у разных людей или органов, но и внутри одного новообразования! Поэтому и иммунный ответ сугубо индивидуален. Выход один — персонализированные вакцины, «сшитые» под конкретного пациента и его рак.

Технологии вроде терапии CAR-T-клетками — яркий пример. Это ювелирная работа: взять клетки пациента, генетически модифицировать их и вернуть обратно. Процесс сложный, дорогой и требует уникальной лабораторной базы.

А ещё данные. Для обучения точной модели нужны огромные массивы информации. По меланоме их много. А по редкой ангиосаркоме — катастрофически мало. Можно ли перенести знания с одного вида рака на другой? Науке это пока неизвестно. Как нет и моделей, способных предсказать реакцию пациента на такую вакцину.

Когда появится вакцина от рака: как искусственный интеллект создает лекарства

Когда человечество получит эффективный препарат от онкологии

Создание противораковой вакцины — одна из величайших медицинских задач. Даже с учётом прогресса назвать точные сроки невозможно. Это не маркетинговый план, а наука.

Для победы нужно решить ряд фундаментальных проблем.

  • Гетерогенность опухолей. Их разнообразие — главный враг. Персонализация лечения требует ещё более сложных алгоритмов и колоссальных объёмов данных.
  • Иммунное уклонение. Рак — мастер маскировки. Он учится обходить защитные системы организма. Найти способ «ослепить» его — задача на годы и огромные ресурсы.
  • Клинические испытания. Это многоэтапный марафон, длящийся годами, а то и десятилетиями. Ускорить его, не жертвуя безопасностью, практически нереально.
  • Регуляторное одобрение. Путь от успешных испытаний до аптечной полки тоже отнимает много времени. Бюрократия — неотъемлемая часть безопасности.

Перспективы на будущее

Оптимисты верят, что эффективная и безопасная вакцина появится в ближайшие 5-10 лет. Их надежды подпитывает невероятный прогресс последних лет. Реалисты же понимают: создание универсального решения может затянуться на куда более долгий срок. Но разве этот путь не стоит того, чтобы его пройти?